Sinds ze zich kon herinneren, had Shino Akitsu het vermogen om te zien wat anderen niet konden zien: geesten, verschijningen en onbeschrijfelijke wezens. Als volwassene leidt dit talent haar ertoe om zich aan te sluiten bij een geheime overheidsinstantie: The Occult Action Department. Haar opdracht is bij het Zesde Speciale Preventiebureau en het is haar taak om de machtige wezens in de gaten te houden die reizen tussen haar wereld en de werelden daarbuiten. Vanuit haar kantoor in Sakuratani, een stad in een andere dimensie, ontmoet Agent Shino verschillende buitenaardse individuen met enorm verschillende persoonlijkheden en vaardigheden: een negenstaartige vossengeest, een ondeugende oni en meer.

Deels poortwachter, deels reisgids, ze doet haar best om deze entiteiten te leren kennen en te voorkomen dat ze in interdimensionale problemen komen.